El Consejo Regulador de la Denominación de Origen de los Vinos de Alicante está gobernado por una Junta Directiva cuyo máximo representante es el Presidente quien desempeña las funciones de representación legal e institucional ante cualquier otra entidad, organismo o institución. En la actualidad, el Presidente del Consejo Regulador de la Denominación de Origen de los Vinos de Alicante es D. José Juan Reus Reus.
En el Órgano de Gestión participan un Director y las distintas Comisiones entre las que destacan la Económica, la de Promoción y la del Fondillón.
El Órgano de Certificación es totalmente independiente y se articula en torno a una Comisión de Certificación que cuenta con agentes externos al sector (como los consumidores). Cuenta con un Director Técnico, Auditores y Comité de Cata.